Trots intensiv forskning så saknas det i dagsläget effektiv behandling för en stor andel av de hjärntumörer som drabbar barn. Det är därför mycket viktigt att nya idéer testas i detta forskningsområde. Fram till nu så har den största delen av molekylär forskning på hjärntumörer fokuserat på den delen av arvsmassan som kodar för protein. Vår hypotes är dock att en del av nyckeln till att förstå hjärntumörer finns att hitta i det DNA som är icke-kodande, förr ofta kallat skräp-DNA. Icke kodande-DNA gör inga proteiner och definieras inte som gener. Detta har lett till att denna del av arvsmassan ofta försummas i forskningsstudier. Detta är anmärkningsvärt då endast 2% av människans DNA består av sekvenser som kodar för gener, medan resten utgörs av icke-kodande DNA.
I det här projektet kommer vi studera den typen av icke-kodande DNA som kallas transposoner, vilka är repetitiva DNA-sekvenser som utgör mer än 50% av vår arvsmassa. Transposoner är virusliknande DNA-sekvenser som under miljontals år av evolution har inkorporerat sin arvsmassa i vårt DNA. Nya data från vårt laboratorium och andra forskargrupper tyder överraskande på att transposoner spelar en viktig roll i olika tumörsjukdomar, inklusive hjärntumörer hos barn. I detta projekt kommer vi att undersöka och klarlägga den roll som transposoner spelar för utveckling och progression av dessa tumörer. Vi kommer att använda oss utav CRISPR-baserad geneditering som inaktiverar utvalda transposoner och låter oss undersöka dess påverkan på tumörcellers fysiologi.
Målet med vår forskning är att förstå hur transposoner bidrar till uppkomst och progression av hjärntumörer hos barn. Om vår hypotes stämmer så kommer detta öppna upp för helt ny förståelse av de molekylära mekanismerna som driver dessa tumörer. På lång sikt kommer detta leda till nya behandlingsstrategier.