Övervakning av pediatriska hjärntumörer genom analys av protein och exosomer i cerebrospinalvätska
Övervakning av pediatriska hjärntumörer genom analys av protein och exosomer i cerebrospinalvätska
Hjärntumörer hos barn behandlas i dagsläget med operation, cellgifter och strålning. Efter att behandlingen påbörjats så följs barnet med magnetkameraundersökningar och provtagning av celler från ryggmärgsvätskan (cerebrospinalvätska, CSV) för att detektera kvarvarande tumörceller eller återfall som behöver åtgärdas. Med nuvarande metoder återfall upptäcks först när de har blivit relativt stora och många gånger redan spridit sig. Målet med detta projekt är att utveckla metoder för att upptäcka återfall eller kvarvarande tumör tidigare, när de fortfarande är i mikroskopisk storlek, så att behandling kan påbörjas tidigare och överlevnaden förbättras.
För att uppnå detta deltar jag i ett nationellt samarbete som samlat CSV från patienter i olika faser av behandling. Vi kommer utforska två komponenter i CSV som är lovande tumörmarkörer, proteiner och exosomer. Först kommer vi att analysera CSV från patienter och friska kontroller för att identifiera proteiner som är unika för hjärntumörer. Tidigare har detta varit svårt att utföra på grund av den låga koncentrationen protein som finns i CSV, men tack vare den nya mycket känsliga och specifika metoden ”proximity extension assay” (PEA) som kan analysera mer än 3000 proteiner från mycket små mängder CSV, så har jag starka förhoppningar om att hitta nya tumörmarkörer.
Jag kommer också att undersöka exosomer, vilket är små avknoppningar av cellmembran som finns fritt i CSV. Vi har sett att exosomer från tumörceller har en unik samansättning av proteiner i sitt membran mot vilka vi planerar att utveckla test för att med hög känslighet kunna följa dessa hos patienter. Eftersom exosomer kommer från celler innehåller de också många av de beståndsdelar som finns inuti dessa, bland annat mRNA, som är unikt för varje celltyp, som jag kommer sekvensera för att identifiera tumörspecifika exosomer.
Jag hoppas med detta projekt hitta nya strategier för att tidigare upptäcka återfall hos barn som behandlats för hjärntumörer.