Systemimmunologisk analys av barn med solida tumörer - ISAC studien
Systemimmunologisk analys av barn med solida tumörer - ISAC studien
Härmed söker vi stöd för att expandera och vidareutveckla vårt Immunsystem Against Cancer (ISAC) projekt, målet med vilket är att förbättra förståelsen av immunsystemets sammansättning och funktion hos barn med cancer genom att utföra omfattande, longitudinell immunövervakning
på systemnivå före, under och efter behandling för solida tumörer. ISAC är nu det största pan-cancerprogrammet i världen med fokus på immunsvar vid pediatrisk cancer. Sedan mars 2018 har vi följt 338 barn på Barnonkologen, Karolinska Universitetssjukhuset. Vi studerar immunsystemet på ett övergripande sätt med nyutvecklad metodik hos barn som drabbats av solida tumörer, från första diagnos och genom hela sjukdoms och behandlingsförloppet. Tack vare teknikutvecklingen de senaste åren kan vi studera det komplexa immunsystemet på systemnivå, med metoder som analyserar alla immunceller, substanserna med vilka de kommunicerar samt generna som styr deras funktion (masscytometri, plasmaproteinprofilering samt mRNA-sekvensering) och därmed skapa en helhetsbild av immunsystemet. Resultaten kan sedan kombineras med maskininlärningsalgoritmer för att leta efter specifika mönster som kan förutspå behandlingsresultat såväl som komplikationer. Projektet har nu genererat tillräckligt med data för att ge en första beskrivning av basala egenskaper hos 161 barn från kohorten som för närvarande är under "resubmission" till Cell (se mer detaljerad preliminär data i forskningsprogrammet). Denna första rapport avslöjar flera nya fynd gällande hel-genom sekvensering av solida tumörer, faktorer som orsakar variationer i immuntillstånd och klonalt expanderade T-cellssvar. ISAC-studien rekryterar fortfarande nya patienter men inkluderar nu ett antal patienter som har övervakats till efter avslutad behandling, vilket betyder att vi nu har tillräcklig statistisk kraft för att besvara nya frågeställningar kring longitudinella aspekter som svar på behandling, återhämtningsmönster och biverkningar.