Proteogenomik för utveckling av immunterapier för barn med leukemi
Proteogenomik för utveckling av immunterapier för barn med leukemi
Akut lymfatisk leukemi (ALL) är den vanligaste cancerformen hos barn. Trots att dagens behandlingar har förbättrat överlevnaden kraftigt, finns fortfarande en stor risk för återfall och långsiktiga biverkningar. Därför behövs nya behandlingsstrategier, särskilt strategier för individualiserad behandling baserad på leukemicellernas biologiska egenskaper.
I detta projekt har vi använt proteogenomik, en metod som kombinerar storskaliga proteinanalyser med genetiska och RNA-baserade data från samma patientprov. Denna teknik gör det möjligt att kartlägga hur leukemiceller utvecklas, hur de undgår kroppens immunförsvar och vilka nya målproteiner som kan användas för behandling.
Våra analyser av barntumörer har visat att leukemiceller kan skapa nya typer av proteiner, så kallade neoantigener, som inte finns i friska celler. Dessa uppstår ofta från delar av arvsmassan som normalt är inaktiva, men som aktiveras i vissa leukemityper. Eftersom neoantigener är unika för tumörcellerna har de stor potential att användas för att utveckla nya immunterapier, till exempel vacciner eller CAR-T-cells-behandlingar. Vi har även kunnat hitta liknande neoantigener i barn akut myeloisk leukemi (AML), vilket ger nya ledtrådar till hur sjukdomen kan angripas.
Resultaten från projektet stärker möjligheten att använda proteogenomik i framtida barncancervård. De ger underlag för mer individanpassade behandlingar och för utveckling av immunterapier riktade mot särskilda undergrupper av ALL. På sikt kan detta bidra till både högre överlevnad och färre biverkningar för barn som drabbas av leukemi.