Helgenomskaraktärisering av metyleringsförändringar vid T-cells maligniteter
Helgenomskaraktärisering av metyleringsförändringar vid T-cells maligniteter
I dag överlever ca 90% av alla barn som diagnostiseras med akut lymfatisk leukemi (ALL), men av de som inte överlever sjukdomen dör ca hälften av behandlingsrelaterade komplikationer. Behovet av att individanpassa behandlingen är stort. Aktuella behandlingsprotokoll baseras på block med olika cellgifter, och inför behandlingsstart delas patienterna upp i grupper baserat på prognosmarkörer som genetiska avvikelser, blodcellskomposition eller ålder. För en undergrupp av akut leukemi, som utgår från T-cellerna (T-ALL), finns få prognosmarkörer utöver MRD (minimal residual disease, ett mått på sjukdomssvar efter första behandling), och patienterna får initialt högintensiv behandling.
Vi har tidigare sett att patienter med T-ALL kan delas upp i två grupper baserat på DNA-metyleringsmönster, en epigenetisk markör. Dessa två grupper har olika prognos, och risken för senare återfall i sjukdomen skiljer sig. Hur dessa DNA-metyleringsförändringar uppstår eller förändras vid den maligna omvandlingen av T-cellen är ännu okänt. Det återstår även att få klarhet i hur biologin bakom de olika grupperna skiljer sig och varför de medför olika risk för återfall.
Detta projekt syftar till att studera metyleringsmönster såväl som genetiska förändringar och genuttryck i T-ALL från patienter, för att utröna om de epigenetiska grupperna skiljer sig med avseende på andra biologiska markörer. Vidare kommer friska T-celler och T-celler under malign omvandling att studeras för att försöka finna hur de epigenetiska förändringarna uppstår och sprider sig över tid när cellen blir elakartad. Målsättningen är att bättre biologisk förståelse för de epigenetiska förändringarna vid T-ALL ska bidra till att patienter kan få en bättre uppskattning av prognos vid behandlingsstart och därmed få stöd vid val av typ av behandling. En djupare förståelse för biologin bakom T-ALL kan också på sikt identifiera nya behandlingsmål och mer individanpassade behandlingsstrategier.