Förbättrad precisionsdiagnostik av barncancerpredisposition
Förbättrad precisionsdiagnostik av barncancerpredisposition
Studien är en fortsättning på vår nationella GMS-barncancerpredispositionsstudie (GMS ChiCaP), där vi nu vill utnyttja tidigare insamlade samtycken, sekvensdata och klinisk information som sparats på Barntumörbanken (BTB) för att undersöka den sanna förekomsten och kliniska betydelsen av barncancerpredisposition.
Vi har nyligen publicerat resultaten av den första delen av GMS ChiCaP studien i Lancet Health Europe, där vi utförde klinisk undersökning och helgenomsekvensering (WGS) i normalvävnad samt analyserade en 189-gens panel för cancerpredisposition. Vi rapporterade en prevalens av ChiCaP-diagnoser på 11% (35/309), varav 69% var okända vid cancerdiagnos och 64% var de novo-mutationer. ChiCaP diagnoser var vanligast hos patienter med icke-cancerrelaterade sjukdomar eller som uppfyllde flera kliniska ChiCaP-kriterier. Dessa diagnoser ledde till skräddarsydd uppföljning i 86% av fallen och behandlingsändringar i 31%. Som ett resultat har ChiCaP-genanalys, tack vare vår studie, integrerats i rutindiagnostik för barncancer i Sverige sedan maj 2024.
Eftersom undersökning med 189-genpanelen inte hittade den genetiska orsaken hos 74 barn med stark klinisk misstanke om cancerpredisposition, vill vi nu gå vidare med mer omfattande genetiska studier i denna högriskgrupp. Målet är att upptäcka oupptäckta predispositionssyndrom och utvärdera om mer omfattande genetisk testning bör erbjudas vid cancerdiagnos, samt att utvärdera om long-read sekvensering och djupexomsekvensering kan ersätta de metoder som används idag. Vi kommer att använda den modernaste gentekniken och utföra short-read WGS-trio, long-read DNA och RNA-sekvensering, djupexomsekvensering och EpiCarrays och all data kommer att återföras till Barntumörbanken (BTB) där vi planerar att samarbeta och kombinera analys av tumör och normalvävnad.
Vi kommer också att undersöka den psykosociala påverkan av genetisk testning på familjer, med syfte att förbättra kliniska rutiner för genetisk vägledning.