Evolutionsbaserade strategier för att förebygga och förutsäga återfall i barncancer
Evolutionsbaserade strategier för att förebygga och förutsäga återfall i barncancer
Trots framsteg inom barncancerbehandling är återfall som inte svarar på behandling fortfarande den vanligaste dödsorsaken. Vårt mål är att förstå hur cancerceller utvecklar motstånd mot läkemedel samt hur vi kan förutse, förebygga och stoppa denna utveckling.
Med hjälp av avancerad bioinformatik kartlägger vi hur olika grupper av cancerceller (subkloner) förändras under behandling och vid återfall. Genom att analysera tumörer från flera regioner och tidpunkter hos en patient kan vi rekonstruera cancerns evolution och svara på frågor såsom: Stammar återfallet från en enda cell eller från flera? Kommer det från en enda lokal, i så fall var? När började återfallet växa?
Projektet bygger på två pågående barncancerstudier (GMS Barncancer och SIOP UMBRELLA) med sammanlagt över 700 patienter. Vi undersöker tre centrala frågor med skilda tidsperspektiv:
- En ögonblicksbild: kan genetisk variation mellan cancerceller i ett enskilt tumörprov berätta för oss hur väl den svarar på behandling?
- Kartläggning bakåt i tiden: vilken evolutionär process ger upphov till återfall och vilken mikromiljö i kroppen kommer återfall ifrån?
- Kartläggning framåt i tiden: kan evolutionära mönster användas för att förutspå när ett återfall sker och vilken genetisk profil det har?
Genom att koppla genetiska data till klinisk information vill vi ta fram riktlinjer för tumörprovtagning och utveckla metoder för att förutsäga återfall genom mätningar gjorda på en tumörs evolutionära parametrar, ex vis hur stort släktträd den har vid diagnos. Studien vill också undersöka det potentiellt kliniska värdet av att genomföra kartläggning av evolutionära processer efter döden hos barn som avlider i obotlig cancer -- kan en så kallad molekylär obduktion berätta för oss när en cancer blev obotlig?
På sikt strävar vår forskning mot att bidra till mer träffsäkra behandlingar, bättre övervakning av cancercellers utveckling i kliniken och en ökad chans att stoppa återfall innan de blir livshotande.