Fusionsgener som mål för riktad behandling av hjärntumörer hos barn
Fusionsgener som mål för riktad behandling av hjärntumörer hos barn
Hjärntumörer hos barn är den mest vanliga solida tumören hos barn och också den mest svårbehandlade patientgruppen av barncancer. Detta med anledning av tumörernas lokalisation och de seneffekter som både tumörskadan mot hjärnan och traditionell behandling medför. Nya behandlingsformer med målinriktade terapier behövs för att minska skadan på friska celler. Genomisk profilering har börjat kartlägga tumördrivande förändringar, utvecklat molekylär kategorisering av tumörtyper och riktade terapier. Fusionsgener (sammanfogning av två gener), identifieras nu i allt större antal i barnhjärntumörer. Fusionsgener driver tumörutveckling, och utgör därför attraktiva mål för riktad behandling, men fungerar även som diagnostiska markörer tack vare deras specifika uttryck endast i tumörvävnaden. Dock uppstår de ofta genom komplexa förändringar på DNA-nivå som ibland kan vara svåra att hitta med dagens metoder. Specifika mål i projektet är att 1) utvärdera en ny optisk mappning (OGM) metod i kombination med transkriptom- sekvensering för genetisk kartläggning av komplexa strukturella varianter som kan ge upphov till fusionsgener 2) funktionellt studera fusionsgener och de nedströms signaleringsvägar som driver tumörutveckling 3) implementera och validera nya molekylära metoder för snabb fusionsdetektion i klinisk diagnostik. Terapiresistenta, progredierande solida tumörer utgör ett stort problem i klinisk barnonkologi, särskilt när tumörerna är inoperabla. Med det senaste FDA- och TLV- godkännandet av larotrectinib (pan-TRK-hämmare) för barn under 18 år, samt FDA-godkännande av entrectinib (ROS1/ ALK/ pan-TRK-hämmare) är det av stort intresse att karakterisera tumörer hos de barn som kan ha nytta av dessa behandlingar. Projektet bidrar till ökad kunskap kring de mekanismer som driver fusionsgeners påverkan på signalvägar och tumörutveckling, förbättrad genetisk diagnostik som möjliggör riktad behandling, samt implementering av nya metoder i hälso- sjukvård.