Epigenetisk karakterisering av genfusionsdrivna sarkom hos barn

Epigenetisk karakterisering av genfusionsdrivna sarkom hos barn

Mjukdelssarkom är ett samlingsnamn för maligna tumörer som uppkommer i kroppens stödjevävnader. Det finns flera olika undergrupper av mjukdelssarkom och tillsammans utgör de upp till 10% av alla maligniteter hos barn. Flera av dessa tumörtyper drivs av specifika genetiska förändringar som resulterar i att två skilda gener slås ihop till en ny så kallad fusionsgen. Dessa nya gener bildar protein med helt unika egenskaper som har visat sig vara avgörande för omvandlingen av en normal cell till en tumörcell. Ny forskning har visat att denna omvandling i hög grad möjliggörs genom att fusions-protein samverkar med och påverkar proteiner (sk epigenetiska regulatorer) som styr vilka delar av arvsmassan som är aktiva respektive inaktiva. I detta projekt kommer vi att använda oss av avancerade metoder för att studera epigenetiska förändringar i sarkom hos barn med målet att identifiera nya behandlingsmål. Utöver att kartlägga epigenetiska förändringar i patientmaterial kommer vi att använda oss av cellsystem för att utvärdera möjligheten att använda kemiska och genetiska inhibitorer för att upphäva de patogena kromatintillstånd som fusions-proteinerna inducerar. Projektet kommer initialt att fokusera på synoviala sarkom, den vanligaste undergruppen av sarkom bland tonåringar. Projektet kommer sedan att expanderas och inkludera flera undergrupper av fusions-drivna sarkom hos barn. Gemensamt för dessa tumörer är att de vid spridd sjukdom har mycket dålig prognos och saknar effektiva behandlingar. Vi hoppas att ytterligare kunskap om hur fusionsproteiner påverkar cellers kromatintillstånd kommer att resultera i nya behandlingsmål och utveckling av förfinade behandlingsstrategier.